Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms