Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms