Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms