Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms