Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms