Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms