Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSEN34Q9BSV6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms