Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATG101Q9BSB4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATG101Q9BSB4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATG101Q9BSB4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms