Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGIP1Q9BQI5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms