Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT140Q96RY7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms