Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC126Q96EE4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms