Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDF1Q96CC6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms