Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms