Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms