Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms