Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms