Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RNF182Q8N6D2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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RNF182Q8N6D2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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RNF182Q8N6D2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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RNF182Q8N6D2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF182Q8N6D2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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