Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXP5

C11orf53, Uncharacterized protein C11orf53, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf53Q8IXP5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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C11orf53Q8IXP5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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C11orf53Q8IXP5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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C11orf53Q8IXP5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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C11orf53Q8IXP5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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C11orf53Q8IXP5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C11orf53Q8IXP5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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