Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms