Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms