Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms