Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms