Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms