Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms