Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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