Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP2Q16527 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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