Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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ZFHX3Q15911 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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