Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED1Q15648 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms