Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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