Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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