Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
TCOF1Q13428 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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