Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.223e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.263e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DDX54-209ENST00000551912 458 ntTSL 222.03■■□□□ 1.125e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.489e-14■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.281e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.871e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TNFRSF12A-203ENST00000571351 1678 ntTSL 223.51■■□□□ 1.351e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.331e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.521e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 FADS3-206ENST00000527379 768 ntTSL 317.68■□□□□ 0.426e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DEDD-208ENST00000486041 1068 ntTSL 316.1■□□□□ 0.171e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DEDD-210ENST00000490843 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DEDD-201ENST00000368005 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.451e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DEDD-206ENST00000472996 314 ntTSL 37.34□□□□□ -1.231e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DEDD-209ENST00000489249 1116 ntTSL 27.03□□□□□ -1.281e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ATP5G2-203ENST00000495596 1976 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.026e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-202ENST00000593637 1043 ntTSL 326.64■■□□□ 1.867e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-209ENST00000596953 1043 ntTSL 226.64■■□□□ 1.867e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.837e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-210ENST00000597607 1164 ntTSL 320.21■□□□□ 0.837e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.547e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.547e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-216ENST00000598987 1202 ntTSL 218.42■□□□□ 0.547e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-225ENST00000601652 551 ntTSL 417.23■□□□□ 0.357e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-211ENST00000598298 868 ntTSL 515.19■□□□□ 0.027e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-205ENST00000594807 569 ntTSL 414.8□□□□□ -0.047e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-219ENST00000600076 484 ntTSL 311.67□□□□□ -0.547e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-212ENST00000598333 822 ntTSL 311.67□□□□□ -0.547e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TECR-208ENST00000596164 245 ntTSL 38.68□□□□□ -1.027e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 RPL23-210ENST00000584583 429 ntTSL 29.5□□□□□ -0.891e-84■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.023e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-205ENST00000585913 833 ntTSL 326.19■■□□□ 1.783e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.743e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-208ENST00000586548 1734 ntTSL 324.78■■□□□ 1.563e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.553e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.373e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.223e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-210ENST00000586636 938 ntTSL 222.39■■□□□ 1.173e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-232ENST00000591376 830 ntTSL 322.39■■□□□ 1.173e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-237ENST00000592234 571 ntTSL 522.39■■□□□ 1.173e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.153e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.153e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.033e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.973e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-206ENST00000585914 1052 ntTSL 520.75■□□□□ 0.913e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-212ENST00000587169 3028 ntTSL 218.46■□□□□ 0.553e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-228ENST00000590347 3117 ntTSL 216.05■□□□□ 0.163e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CIRBP-242ENST00000593093 3528 ntTSL 215.49■□□□□ 0.073e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.066e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.236e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.396e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.446e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 MRPS15-202ENST00000462067 1612 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.097e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 HPCAL1-204ENST00000422133 587 ntTSL 311.89□□□□□ -0.517e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 TGFB1-204ENST00000600196 399 ntTSL 514.39□□□□□ -0.118e-10■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 AGTRAP-213ENST00000513739 566 ntTSL 314.26□□□□□ -0.131e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.32e-11■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-11■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 AKT1-209ENST00000554585 858 ntTSL 320.21■□□□□ 0.832e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 RPL39-203ENST00000477403 405 ntTSL 34.84□□□□□ -1.637e-41■□□□□ 9.7
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PABPC4Q13310 NOP56-214ENST00000484998 998 ntTSL 59.85□□□□□ -0.835e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 27.72□□□□□ -1.175e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.361e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 STAG2-215ENST00000469481 989 ntTSL 318.48■□□□□ 0.555e-14■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 DCTD-207ENST00000507543 1874 ntTSL 515.25■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 EBNA1BP2-202ENST00000431635 1503 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.215e-14■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SRRT-211ENST00000478693 655 ntTSL 213.44□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 POLR2E-202ENST00000585838 487 ntTSL 512.21□□□□□ -0.453e-11■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SRRT-208ENST00000469602 376 ntTSL 211.62□□□□□ -0.551e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 EBNA1BP2-201ENST00000236051 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.615e-14■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 EBNA1BP2-204ENST00000463906 937 ntTSL 27.35□□□□□ -1.235e-14■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.55e-14■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.575e-14■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ANAPC7-211ENST00000552087 910 ntTSL 518.75■□□□□ 0.593e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 POLD2-216ENST00000489883 528 ntTSL 222.78■■□□□ 1.245e-17■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 RPS25-205ENST00000528547 189 ntTSL 35.3□□□□□ -1.561e-323■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.451e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.951e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.881e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.761e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SEPT8-213ENST00000481030 790 ntTSL 314.18□□□□□ -0.141e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.051e-8■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 THOP1-211ENST00000590970 1104 ntTSL 321.41■■□□□ 1.021e-8■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 THOP1-213ENST00000591363 639 ntTSL 519.95■□□□□ 0.781e-8■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.771e-8■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 219.37■□□□□ 0.691e-8■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 COMMD9-203ENST00000452374 917 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-15■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 NACA-214ENST00000550343 343 ntTSL 22.71□□□□□ -1.985e-22■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.485e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.455e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 15e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 15e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ATP5G2-202ENST00000394349 878 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.135e-12■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.875e-12■□□□□ 9.7
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