Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR5A1Q13285 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms