Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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