Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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