Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms