Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms