Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms