Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms