Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms