Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms