Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms