Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms