Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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