Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ACTBP60709 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ACTBP60709 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTBP60709 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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