Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSDMDP57764 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMDP57764 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMDP57764 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMDP57764 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMDP57764 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMDP57764 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMDP57764 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMDP57764 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMDP57764 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms