Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms