Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms