Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms