Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD4P46934 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms