Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms